同年4月3日，他接到了省纪检委打来的电话，要找他谈谈。高勤荣还记得当时的场景，在宾馆里，他翘着二郎腿，心情愉悦地等着谈话。因为他听说，关于运城的假渗灌工程，人民日报的内参发表后，中纪委有关领导已批示，让山西省纪委先行查处。

　　他万万没想到，对方的第一句话是，“你在运城有什么违法乱纪的事情?”

　　高勤荣一听就不对劲，直言不讳地说，“没有!”

　　谈话不欢而散。高勤荣说，之后工作人员又和他谈了三次话，问题很琐碎：你的BB机哪里来的?手机哪来的?有人给你送过烟吗?你是不是在歌厅唱过歌?

　　调查半年之后，最终不了了之。

　　调查组走后的两天，1998年9月18日，《南方周末》头版头条报道了“假渗灌”的事情，文章最后还说：高勤荣仅是个普通党员，根本够不上省纪委调查的范围。

　　之后，中央电视台《新闻调查》和《焦点访谈》到运城采访，高勤荣又带他们到他采访过的地方去调查。

　　使高勤荣悲伤的是，当年中央台因为这个节目获了金奖，他却获了罪。

　　有人打电话威胁他：“高勤荣你小心点，老子非要收拾你不可!”老婆在家埋怨，孩子担惊害怕，他的气也不打一处来，多次到北京找人反映情况。

　　但是，负面报道还是“引火烧身”了。

　　狱中8年

　　1998年12月4日，高勤荣在北京被山西省运城3名警察带走。在被带回山西的路上，警察向他出示了“拘留证”。在看守所，他拒绝签字。1999年3月17日，高勤荣被以三项罪名起诉至运城市人民法院。5月4日，法院下达的一份长达17页的判决书上，高勤荣因为“受贿”、“介绍卖淫”、“诈骗”这三项罪名被判处有期徒刑12年。

　　高勤荣提起上诉，但运城地区中级人民法院驳回上诉，维持了原判。

　　终审判决下达后，高勤荣被投入晋中监狱服刑。

　　“全是莫须有的罪名!我打条借钱，又有领导签字，却判我诈骗;别人还我家借款，我有书证，法院不予采纳，判我受贿;其他人嫖娼，又判我介绍卖淫。他们这样做，一是为打击报复，泄私愤;二是不让记者说真话。”现在说起来，高勤荣依然愤怒。

　　在监狱里，他写了几百封信申诉，有写给运城中院的，也有写给中央有关部门的。他认为自己是曝光了运城“假渗灌工程”之后遭遇打击报复，是冤案，但是信件石沉大海。

　　晋中监狱知道高勤荣是个记者，把他调到了《晋中监狱报》任组长。他在服刑人员中寻找典型进行采访报道。在2002年举办的全国8省市监狱报刊评比中，高勤荣一人独得两个一等奖，他也因此获得了减刑的机会。

　　但对自己的罪行，高勤荣从不接受。每年年底写总结，总有一栏为“认罪服法态度”，但他从来不认罪，而是填上自己的冤屈。