他依然坚持多年来的工作习惯：每天7点到办公室，晚上11点后离开，有人形象地将其称为“711”，这也正是他为勉励自己在物理所办公室上选定的门牌号。

　　学生爱叫他“恩哥老师”

　　1999年，年仅42岁的王恩哥成为中科院物理所所长。但在2009年，他再次做出一个出乎众人意料的决定：回到北大担任物理学院院长。他在一个月内辞去了中科院的所有行政职务。

　　如何吸引和凝聚最优秀的人才是摆在王恩哥面前的重要问题。有了解情况的老师跟王恩哥说，“老王，我们没法跟人比啊，人家来一个人给十万年薪，还给房子，咱们就五万，还没房子。”但王恩哥有方法，“以前一年进十个的话，现在一年少进几个，把十个人的待遇集中用!”

　　在他的感召下，谢心澄(现任北大物理学院院长)、陈东敏(现任北大产业技术研究院院长)等一大批科学家先后加盟北大。

　　2011年1月开始，王恩哥担任北京大学党委常委、副校长、教务长、常务副校长，走上学校的领导岗位。他率先提出“小班课教学”理念并在全校试点。很多师生都称他为“恩哥老师”，公认他有务实、低调、实干。他也喜欢跟学生在一起，经常回邮件给素不相识的学生，主动约时间做科研探讨。